Obiettivi formativi
CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE
L’obiettivo principale del corso è quello di permettere allo studente di acquisire conoscenze approfondite sulle nuove metodologie su scala genomica sviluppate e sulle loro possibili applicazioni in diversi campi della ricerca scientifica.
CAPACITÀ DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE
Al termine del corso ci si attende che lo studente sia in grado di interpretare ed intraprendere studi di tipo genomico utilizzando le diverse metodologie apprese durante il corso. Lo studente sarà anche in grado di analizzare in maniera critica “case study” tratti dalla letteratura scientifica.
AUTONOMIA DI GIUDIZIO
Alla fine del corso lo studente sarà in grado di valutare in modo critico l’affidabilità degli studi genomici presi in esame e sarà in grado di identificare in modo autonomo gli approcci più idonei e le strategie sperimentali più efficaci per la risoluzione di problematiche scientifiche complesse.
ABILITÀ COMUNICATIVE
Alla fine del corso ci si attende che lo studente sia in grado di esporre argomenti scientifici complessi utilizzando un linguaggio scientifico appropriato.
CAPACITA' DI APPRENDIMENTO
Alla fine del corso ci si attende che lo studente abbia acquisito gli strumenti metodologici necessari per studiare in un modo autonomo e collegare le informazioni apprese durante il corso con quelle apprese in altre discipline.
Prerequisiti
Conoscenze di base di genetica, biochimica e biologia molecolare.
Contenuti dell'insegnamento
Il corso fornirà informazioni approfondite sulle metodologie e strategie per lo studio dei genomi di organismi semplici e complessi.
Nello specifico durante il corso verranno trattati i seguenti argomenti:
- Strategie di sequenziamento di un genoma e applicazioni delle tecniche di “Next Generation Sequencing (NGS)"
- Assemblaggio ed annotazione di un genoma
- "Whole genome and exome sequencing"
- Studio dei più rilevanti progetti genomici conclusi e in corso
- Analisi del trascrittoma: metodologie “single gene” e “high-throughput” a confronto. Real time PCR e digital PCR; Microarray e RNA-sequencing
- Analisi dei profili di espressione di non coding RNA
- Analisi dei polimorfismi
- “Genome-wide association study” (GWAS) ed altri approcci genomici per applicazioni in ambito biomedico e ambientale
- Epigenomica
- Analisi di "case study” tratti dalla letteratura
Programma esteso
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Bibliografia
- "Genetica molecolare umana". Strachan T. et al. Zanichelli
- “Genomi (IV edizione)”. Brown T.A. EdiSES
- “Fondamenti di bioinformatica”. Citterich M.H. et al. Zanichelli
- "Genetica & genomica nelle scienze mediche”. Strachan T. et al. Zanichelli
Materiale addizionale fornito dal docente: slide e articoli scientifici di approfondimento
Metodi didattici
Il corso è organizzato in lezioni frontali e seminari di approfondimento con diversi momenti di interazione e di condivisione con gli studenti attraverso la discussione di “case study” della letteratura.
Modalità verifica apprendimento
La verifica dell'apprendimento si basa su una prova orale che prevede la preparazione di una presentazione da parte dello studente su un argomento concordato con il docente. Durante la presentazione, verranno fatte domande di teoria sugli argomenti trattati a lezione per valutare la completa preparazione dello studente.
Questo tipo di esame permetterà di valutare non solo le conoscenze acquisite dallo studente durante il corso, ma anche la capacità di applicare tali conoscenze alla risoluzione di problemi di tipo sperimentale.
Conoscenze, applicazione delle conoscenze, autonomia di giudizio, capacità di apprendimento e abilità comunicative saranno verificate durante la discussione della presentazione e attraverso la risposta alle domande di teoria sugli argomenti trattati a lezione.
Altre informazioni
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Obiettivi agenda 2030 per lo sviluppo sostenibile
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