Obiettivi formativi
CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE
L’obiettivo principale del corso è quello di far acquisire allo studente conoscenze approfondite sulle nuove metodologie su scala genomica sviluppate e sulle loro possibili applicazioni in diversi campi della ricerca scientifica.
CAPACITÀ DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE
Al termine del corso ci si attende che lo studente sia in grado di interpretare ed intraprendere studi di tipo genomico utilizzando le diverse metodologie apprese durante il corso. Lo studente sarà anche in grado di analizzare in maniera critica “case study” tratti dalla letteratura scientifica.
AUTONOMIA DI GIUDIZIO
Alla fine del corso lo studente sarà in grado di valutare in modo critico l’affidabilità degli studi genomici presi in esame e sarà in grado di identificare in modo autonomo gli approcci più idonei e le strategie sperimentali più efficaci alla risoluzione di problematiche scientifiche complesse.
ABILITÀ COMUNICATIVE
Alla fine del corso lo studente dovrebbe essere in grado di esporre argomenti scientifici complessi utilizzando un linguaggio scientifico chiaro e appropriato.
CAPACITA' DI APPRENDIMENTO
Il corso fornisce allo studente gli strumenti metodologici necessari per studiare in un modo autonomo e collegare le informazioni apprese durante il corso con quelle apprese in altre discipline.
Prerequisiti
Conoscenze di base di genetica, biochimica and biologia molecolare.
Contenuti dell'insegnamento
Il corso fornirà informazioni approfondite sulle metodologie e le strategie per lo studio dei genomi di organismi semplici e complessi.
Nello specifico verranno trattati i seguenti argomenti:
- Mappatura dei genomi
- Strategie di sequenziamento di un genoma e tecniche di “Next Generation Sequencing (NGS)"
- Assemblaggio ed annotazione del genoma
- "Whole genome and exome sequencing". "Variant calling"
- Studio dei più rilevanti progetti genomici conclusi e in corso
- Analisi del trascrittoma: metodologie “single gene” e “high-throughput”
- Quantificazione dei livelli di espressione genica: Real Time PCR e digital PCR
- Microarray e confronto con tecniche basate su NGS (RNA-seq)
- Analisi dei profili di espressione di non coding RNA
- “Genome-wide association study” (GWAS) ed altri approcci genomici per applicazioni in ambito biomedico e ambientale
- Epigenomica
- Analisi di "case study” tratti dalla letteratura
Programma esteso
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Bibliografia
“Genomi (IV edizione)”. Brown T.A. EdiSES.
“Fondamenti di bioinformatica”. Citterich M.H. et al. Zanichelli.
“Genetica & genomica nelle scienze mediche”. Strachan T et al. Zanichelli.
Materiale addizionale fornito dal docente: slide e articoli scientifici di approfondimento.
Metodi didattici
Il corso è organizzato in lezioni frontali e seminari di approfondimento, ma prevede diversi momenti interattivi con gli studenti (discussioni di “case study” della letteratura ed analisi di dati genomici). A causa dell’emergenza sanitaria, le lezioni saranno svolte in presenza in aula con streaming sincrono online (via Teams) e le registrazioni delle lezioni saranno caricate sulla pagina Elly del corso.
Modalità verifica apprendimento
La valutazione dei risultati di apprendimento si basa su una prova orale che prevede la preparazione di una presentazione con slide da parte dello studente su un argomento concordato con il docente. Questo tipo di esame premetterà di valutare non solo le conoscenze acquisite dallo studente durante il corso, ma la capacità di applicare tali conoscenze alla risoluzione di problemi di tipo sperimentale.
Conoscenze, applicazione delle conoscenze, autonomia di giudizio e capacità di apprendimento sono quindi verificate durante la discussione della presentazione e della relazione di laboratorio. Le abilità comunicative sono valutate durante l'esposizione della presentazione e nella risposta alle domande.
Altre informazioni
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Obiettivi agenda 2030 per lo sviluppo sostenibile
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