Obiettivi formativi
CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE
L’obiettivo principale del corso è quello di far acquisire allo studente conoscenze approfondite sulle nuove metodologie su scala genomica sviluppate e sulle loro possibili applicazioni in diversi campi della ricerca scientifica.
CAPACITÀ DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE
Al termine del corso ci si attende che lo studente sia in grado di interpretare ed intraprendere studi di tipo genomico utilizzando le diverse metodologie apprese durante il corso. Lo studente sarà anche in grado di analizzare in maniera critica “case study” tratti dalla letteratura scientifica.
AUTONOMIA DI GIUDIZIO
Alla fine del corso lo studente sarà in grado di valutare in modo critico l’affidabilità degli studi genomici presi in esame e sarà in grado di identificare in modo autonomo gli approcci più idonei e le strategie sperimentali più efficaci alla risoluzione di problematiche scientifiche complesse.
ABILITÀ COMUNICATIVE
Alla fine del corso lo studente dovrebbe essere in grado di esporre argomenti scientifici complessi utilizzando un linguaggio scientifico chiaro e appropriato.
CAPACITA' DI APPRENDIMENTO
Il corso fornisce allo studente gli strumenti metodologici necessari per studiare in un modo autonomo e collegare le informazioni apprese durante il corso con quelle apprese in altre discipline.
Prerequisiti
Conoscenze di base di genetica, biochimica and biologia molecolare.
Contenuti dell'insegnamento
Il corso fornirà informazioni approfondite sulle metodologie e le strategie per lo studio della struttura e delle funzioni dei genomi di organismi semplici e complessi.
Nello specifico verranno trattati i seguenti argomenti:
- strategie di sequenziamento di un genoma e tecniche di “Next Generation Sequencing” (NGS).
- Annotazione del genoma.
- Studio dei più rilevanti progetti genomici conclusi e in corso.
- Analisi del trascrittoma: metodologie “single gene” e “high-throughput”.
- Quantificazione dei livelli di espressione utilizzando metodologie “single gene”: Northern blot, PCR semi-quantitativa, Real Time PCR, digital PCR.
- Microarray e confronto con tecniche basate su NGS (RNA-seq).
- Analisi dei profili di espressione di miRNA.
- Exome sequencing.
- “Genome-wide association study” (GWAS) ed altri approcci genomici per applicazioni in ambito biomedico e ambientale.
- Epigenomica.
- Editing del genoma.
- Case study” tratti dalla letteratura: interpretazione dei risultati utilizzando analisi di tipo funzionale.
Programma esteso
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Bibliografia
“Genomi (IV edizione)”. Brown T.A. EdiSES.
“Fondamenti di bioinformatica”. Citterich M.H. et al. Zanichelli.
“Genetica & genomica nelle scienze mediche”. Strachan T et al. Zanichelli.
Materiale addizionale fornito dal docente: slide e articoli scientifici di approfondimento.
Metodi didattici
Il corso è organizzato in lezioni frontali e seminari di approfondimento, ma prevede anche esercitazioni sull'analisi dei dati genomici in laboratorio informatico.
Modalità verifica apprendimento
La valutazione dei risultati di apprendimento si basa su una prova orale che prevede la preparazione di una presentazione con slide da parte dello studente su un argomento concordato con il docente. Lo studente dovrà, inoltre, portare in sede d'esame una breve relazione sull'attività svolta in laboratorio informatico. Questo tipo di esame premetterà di valutare non solo le conoscenze acquisite dallo studente durante il corso, ma la capacità di applicare tali conoscenze alla risoluzione di problemi di tipo sperimentale.
Conoscenze, applicazione delle conoscenze, autonomia di giudizio e capacità di apprendimento sono quindi verificate durante la discussione della presentazione e della relazione di laboratorio. Le abilità comunicative sono valutate durante l'esposizione della presentazione e nella risposta alle domande.
Altre informazioni
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Obiettivi agenda 2030 per lo sviluppo sostenibile
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