BIOLOGIA DEI SISTEMI
cod. 1004399

Anno accademico 2012/13
3° anno di corso - Secondo semestre
Docente
Settore scientifico disciplinare
Biologia applicata (BIO/13)
Field
A scelta dello studente
Tipologia attività formativa
A scelta dello studente
42 ore
di attività frontali
6 crediti
sede: PARMA
insegnamento
in - - -

Obiettivi formativi

Fornire le conoscenze per capire l'importanza della System biology nelle biotecnologie moderne

Prerequisiti

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Contenuti dell'insegnamento

Introduzione sulla System Biology nel contesto delle biotecnologie moderne



Vie, reti e sistemi in biologia

Contributo della genomica alla system biology

Proprietà delle reti, definizioni generali

Reti fisiche e reti logiche

Reti come grafi

Dinamica, stabilità, robustezza - ridondanza nelle reti

Interazioni nelle reti e funzioni biologiche: vie, nodi

Distribuzioni dei gradi nelle reti

Concetto di “hub”

Reti casuali e reti biologiche

Reti metaboliche

Esempi di reti con fattori di trascrizione e sequenze di DNA: approcci sperimentali per lo studio di tali reti

Esempi di reti in lievito: approcci sperimentali e computazionali

Esempi di reti con interazioni tra proteine: interattomi

Metodi per identificare interazioni proteina-proteina e proteina-DNA

Proprietà biologiche degli hub: conservazione, robustezza, duplicazioni

Limitazioni degli interattomi

Reti di regolazione genica, interazioni proteina-DNA

Operone lattosio in Escherichia coli

Esempi in Caenorhabditis elegans, Saccharomyces cerevisiae e altri organismi

Programma esteso

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Bibliografia

materiale fornito dal docente

Metodi didattici

lezioni frontali e seminari

Modalità verifica apprendimento

esame orale

Altre informazioni

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