Obiettivi formativi
Fornire le conoscenze per capire l'importanza della System biology nelle biotecnologie moderne
Contenuti dell'insegnamento
Introduzione sulla System Biology nel contesto delle biotecnologie moderne
Vie, reti e sistemi in biologia
Contributo della genomica alla system biology
Proprietà delle reti, definizioni generali
Reti fisiche e reti logiche
Reti come grafi
Dinamica, stabilità, robustezza - ridondanza nelle reti
Interazioni nelle reti e funzioni biologiche: vie, nodi
Distribuzioni dei gradi nelle reti
Concetto di “hub”
Reti casuali e reti biologiche
Reti metaboliche
Esempi di reti con fattori di trascrizione e sequenze di DNA: approcci sperimentali per lo studio di tali reti
Esempi di reti in lievito: approcci sperimentali e computazionali
Esempi di reti con interazioni tra proteine: interattomi
Metodi per identificare interazioni proteina-proteina e proteina-DNA
Proprietà biologiche degli hub: conservazione, robustezza, duplicazioni
Limitazioni degli interattomi
Reti di regolazione genica, interazioni proteina-DNA
Operone lattosio in Escherichia coli
Esempi in Caenorhabditis elegans, Saccharomyces cerevisiae e altri organismi
Bibliografia
materiale fornito dal docente
Metodi didattici
lezioni frontali e seminari